Проекты лаборатории в области вычислительной протеомики
Завершился наш первый проект в области вычислительной протеомики в тесном сотрудничестве с UCSD! Яков Сироткин готовит MS-Align к релизу уже в мае 2011 как открытый инструмент анализа протеомных данных. MS-Align доказал свое превосходство над другими алгоритмами для top-down mass spectrometry, технологии протеомики следующего поколения. Этот проект обсуществляется в тесном сотрудничестве между Xiaowen Liu из UCSD и сотрудником нашей лаборатории Яковом Сироткиным. MS-Align был разработан в сотрудничестве с исследователями-экспериментаторами из University of Washington и Pacific Northwest National Lab.
Лаборатория начала новое сотрудничество в области протеомики с Михаилом Дубиной из Санкт-Петербургского Академического университета по идентификации пептидов, полученных с помощью undirected peptide synthesis.
Лаборатория начала новое сотрудничество в области протеомики с Кирой Вяткиной из Санкт-Петебургского Государственного Университета. Целью сотрудничества является разработка нового алгоритма морфинга белков и запуск веб-сервера для морфинга белков. Морфинг белков является важным шагом в разработке лекарственных препаратов, который используются многими исследователями по всему миру.