Skip to main content

SiBELia 2.0 is out

Comparative genomic tool Sibelia 2.0 is here! With improved performance and new interactive circular visualization for web.

 

Встреча с лабораторией ИТМО

В пятницу состоялась встреча с коллегами из лаборатории «Алгоритмы сборки геномных последовательностей» СПб НИУ ИТМО, которые рассказали нам о разрабатываемых ими алгоритмах сборки генома. 

SPAdes 2.3 released, now with scaffolding

You can download SPAdes 2.3 from http://bioinf.spbau.ru/spades, see new manual and the changelog.

SiBELia: A comparative genomics tool

Today is the first release of SiBELia — Synteny Block ExpLoration tool! It finds synteny blocks in genomes represented as nucleotide sequences using approach based on de Bruijn graphs.

Congratulation to Ilya Minkin — author of SiBELia and grad student at the St. Petersburg Academic Unviersity, and to Son Pham who is supervising this project. For more information please take a look at the poster. We'll be happy to hear your feedback.

 

Конференция HappyDev

Яков Сироткин выступил на конференции HappyDev'12 в Омске и принял участие в круглом столе по проблемам IT-образования.

Наука и образование Санкт-Петербурга

20 сентября на на телеканале ТВЦ был показан репортаж про лабораторию алгоритмической биологии, а также другие научные и образовательные проекты Санкт-Петербурга.

Визит в компанию Биокад

В понедельник сотрудники лаборатории посетили компанию "Биокад" и обсудили с коллегами возможные совместные проекты на стыке геномики и протеомики.

   

Летняя практика в магистратуре

Сегодня прошли отчётные доклады студентов магистратуры и курсов по биоинформатике, проходивших летом практику в лаборатории и компаниях, занимающихся биоинформатикой.

RECOMB-AB and RECOMB-BE 2012 were organized in St. Petersburg

We've ogranized and hosted RECOMB-AB (Open Problems in Algorithmic Biology) and RECOMB-BE (Bioinformatics Education) satellite conferences this year.

It was awesome to see you all in St. Petersburg, we'll post all materials and photos a little bit later.

Syndicate content