Bioinformatics Boot Camp

Семинары покрывают главы книги An Introduction to Bioinformatics Algorithms (Neil C. Jones and Pavel A. Pevzner, MIT Press 2004). Для каждой темы уже есть слайды, которые нужно понять, немного изменить и понятно рассказать всем остальным участникам.

Темы семинаров:

1. Molecular Biology
2. Brute Force: DNA Mapping, Motif Searching
3. Genome Rearrangements
4. Dynamic Programming: Edit Distance, Sequence Alignment
5. Linear Space Alignment, Multiple Alignment
6. Graphs and DNA Sequencing
7. RNA secondary structure prediction, Statistical methods for gene prediction, Similarity-based methods for gene prediction
8. Mass Spectrometry and Proteomics
9. Combinatorial Pattern Matching
10. Clustering
11. Molecular evolution
12. Hidden Markov Models, Randomized Algorithms